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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
17/12/2018 |
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Data da última atualização: |
17/12/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SOUZA, J. S.; CHIARI, L.; RESENDE, R. M. S.; VILELA, M. de M.; SALGADO, L. R. |
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Afiliação: |
Juliana Santos Souza, Universidade Anhanguera - Uniderp/Campus Agrárias; LUCIMARA CHIARI, CNPGC; ROSANGELA MARIA SIMEAO, CNPGC; MARIANE DE MENDONCA VILELA, CNPGC; Leonardo Rippel Salgado, CNPGC. |
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Título: |
Development, Validation and Characterization of Genic Microsatellite Markers in Urochloa Species. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
American Journal of Plant Science, v. 18, n. 3, p. 314-319, July/Sept. 2018. |
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DOI: |
DOI: 10.4236/ajps.2018.92023 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Urochloa (syn. Brachiaria ) cultivars represent 85% of tropical pastures occupying 114 million hectares of cultivated grasslands in Brazil. Despite the commercial importance of the Urochloa species, low molecular information is available and is far from saturating the genome. Investigating and obtaining more markers associated to characteristics of difficult and late expression can benefit in accelerating breeding programs of more important species. Aiming to increase the number of molecular markers, genic microsatellite markers were obtained from transcriptome of U. decumbens and analyzed for their cross-amplification to U. brizantha , U. humidicola and U. ruziziensis . Genic microsatellite markers were isolated from a transcriptome obtained of U. decumbens ?Basilisk? roots. Specific primers were designed for one hundred loci, and 32 were polymorphic presenting polymorphism informative content values ranging of 0.12 to 0.81 (mean 0.54). Amplified microsatellite regions yield an average of 4.44 alleles per locus (ranging of 1 to 13). Cross-amplification to U. brizantha , U. humidicola and U. ruziziensis were successfully performed, although the number of the loci transferred varied among them. Multiple orrespondence Analysis revealed three distinct groups separating accessions and species. Four genetic markers presented high potential to distinguish sexual and apomictic accessions of Urochloa and must be further investigated. The genic markers identified in this study are the first set of expressed sequence tagged molecular markers for Urochloa species. MenosUrochloa (syn. Brachiaria ) cultivars represent 85% of tropical pastures occupying 114 million hectares of cultivated grasslands in Brazil. Despite the commercial importance of the Urochloa species, low molecular information is available and is far from saturating the genome. Investigating and obtaining more markers associated to characteristics of difficult and late expression can benefit in accelerating breeding programs of more important species. Aiming to increase the number of molecular markers, genic microsatellite markers were obtained from transcriptome of U. decumbens and analyzed for their cross-amplification to U. brizantha , U. humidicola and U. ruziziensis . Genic microsatellite markers were isolated from a transcriptome obtained of U. decumbens ?Basilisk? roots. Specific primers were designed for one hundred loci, and 32 were polymorphic presenting polymorphism informative content values ranging of 0.12 to 0.81 (mean 0.54). Amplified microsatellite regions yield an average of 4.44 alleles per locus (ranging of 1 to 13). Cross-amplification to U. brizantha , U. humidicola and U. ruziziensis were successfully performed, although the number of the loci transferred varied among them. Multiple orrespondence Analysis revealed three distinct groups separating accessions and species. Four genetic markers presented high potential to distinguish sexual and apomictic accessions of Urochloa and must be further investigated. The genic markers identified in this study are th... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Signalgrass; Simple Sequence Repeat; Transferability. |
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Thesagro: |
Brachiaria. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/188572/1/8-Development-validation-and-characterization.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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| Registros recuperados : 26 | |
| 1. |  | RAGALZI, C. M.; RESENDE, R. M. S.; VILELA, M. de M.; VENTURA, E. F.; JANK, L. Associação genômica ampla na seleção para apomixia em Panicum maximum jacq. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 11., 2015, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2015. 114 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 213).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 2. | | SANTOS, B. F.; VILELA, M. de M.; CHIARI, L.; LAURA, V. A. Sequenciamento e avaliação da expressão gênica de Urochloa decumbens (Stapf) R.D. Webster sob estresse por alumínio. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 10., 2014, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2014. p. 22-23. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 208). Comissão organizadora: Grácia Maria Soares Rosinha, Alexandra Rocha de Oliveir, Rodrigo Carvalho Alva.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 3. | | OLIVEIRA, A. de; VILELA, M. de M.; PANIAGO, B.; VALLE, C. B. do; JUNGMANN, L. Padronização de parâmetros para análise de microssatélites por eletroforese capilar em Brachiaria spp. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 9., 2013, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2013. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 204). Comissão organizadora: Denise Baptaglin Montagner, Grácia Maria Soares Rosinha, Rodrigo Carvalho Alva.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 5. | | VENTURA, E. F.; RESENDE, R. M. S.; RAGALZI, C. M.; VILELA, M. de M. Distribuição da variação genética entre e dentro de sub-populações de Brachiaria ruziziensis tetraploide e sua aplicação na seleção direcional. WORKSHOP MELHORAMENTO VEGETAL, 2., 2016, Campo Grande, MS. Contribuições, Avanços e perspectivas para o Cerrado brasileiro. Anais... Campo Grande, MS: SBMP, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 6. | | SOUZA, J. S.; CHIARI, L.; RESENDE, R. M. S.; VILELA, M. de M.; SALGADO, L. R. Development, Validation and Characterization of Genic Microsatellite Markers in Urochloa Species. American Journal of Plant Science, v. 18, n. 3, p. 314-319, July/Sept. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 7. | | CHIARI, L.; VILELA, M. de M.; JANK, L.; FERNANDES, C. D. Identification of a putative gene responsive to the fungus bipolaris maydis in guinea grass. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM OF FORAGE BREEDINGS, 5., 2015, Buenos Aires, Argentina. Anais... Faculdade de Agronomia, Universidade de Buenos Aires, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 8. | | SOUZA, J. S.; CHIARI, L.; VILELA, M. de M.; VALLE, C. B. do. Validação de marcadores microssatélites em Urochloa decumbens e avaliação da transferibilidade para outras espécies deste gênero. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 10., 2014, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2014. p. 56-57. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 208). Comissão organizadora: Grácia Maria Soares Rosinha, Alexandra Rocha de Oliveir, Rodrigo Carvalho Alva.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 9. | | RAGALZI, C. de M.; JUNGMANN, L.; RESENDE, R. M. S.; TORRES, F. Z. V.; VILELA, M. de M. Associação genômica ampla na seleção para resistência a Notozulia entreriana em híbridos de brachiaria. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015. 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 10. | | SOUZA, J. S.; CHIARI, L.; VILELA, M. de M.; VALLE, C. B. do; BARRIOS, S. C. L. Prospecção de marcadores moleculares ligados à apomixia em Brachiaria decumbens In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 9., 2013, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2013. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 204). Comissão organizadora: Denise Baptaglin Montagner, Grácia Maria Soares Rosinha, Rodrigo Carvalho Alva| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 11. | | RESENDE, R. M. S.; VILELA, M. de M.; CHIARI, L.; MEIRELES, K. G. X.; JANK, L.; VALLE, C. B. do. Seleção genômica no melhoramento de forrageiras. In: AZEVEDO, A. L. S.; PEREIRA, J. F.; MACHADO, J. C. (Ed.). Melhoramento de forrageiras na era genômica. Brasília, DF: Embrapa, 2019. 262 p. il. color| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 12. | | PIRES, L. P.; COLADO, M. L. Z.; VILELA, M. de M.; LEGUIZAMON, G. O. de C.; MEIRELES, K. G. X. Diferenciação molecular de genótipos de Panicum maximum. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 10., 2014, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2014. p. 66-67. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 208). Comissão organizadora: Grácia Maria Soares Rosinha, Alexandra Rocha de Oliveir, Rodrigo Carvalho Alva.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 13. | | OLIVEIRA, P. B. DE; VILELA, M. de M.; VALLE, C. B. do; SOUZA, A. P.; JUNGMANN, L. Desenvolvimento e caracterização de marcadores moleculares do tipo microssatélites para Brachiaria decumbens e Brachiaria ruziziensis. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 9., 2013, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2013. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 204). Comissão organizadora: Denise Baptaglin Montagner, Grácia Maria Soares Rosinha, Rodrigo Carvalho Alva .| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 14. | | RAGALZI, C. M.; RESENDE, R. M. S.; TORRES, F. Z. V.; VALLE, C. B. do; LIRA, E. C.; VILELA, M. de M.; LEGUIZAMON, G. O. de C.; ALVES. Associação genômica ampla na seleção para resistência a Notozulia entreriana em híbridos de Brachiaria. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 10., 2014, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2014. p. 26-27. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 208). Comissão organizadora: Grácia Maria Soares Rosinha, Alexandra Rocha de Oliveir, Rodrigo Carvalho Alva.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 15. | | LARA, L. A. de C.; SANTOS, J. P. R. dos; SANTOS, M. F.; CHIARI, L.; VILELA, M. de M.; JANK, L.; GARCIA, A. A. F. Predictive ability of G-Blup model in a tetraploid sexual population of Panicum maximum. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Maringá, PR: SBMP, 2017. p. 93| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 16. | | VENTURA, E. F.; RAGALZI, C. M.; RESENDE, R. M. S.; TORRES, F. Z. V.; VILELA, M. de M.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do. Seleção genômica ampla para resistência a Notozulia entreriana e modo de reprodução em Brachiaria. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 11., 2015, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 17. | | SALGADO, L. R.; LIMA, R.; SANTOS, B. F. dos; SHIRAKAWA, K. T.; VILELA, M. de M.; ALMEIDA, N. F.; PEREIRA, R. M.; NEPOMUCENO, A. L.; CHIARI, L. De novo RNA sequencing and analysis of the transcriptome of signalgrass (Urochloa decumbens) roots exposed to aluminum. Plant Growth Regulation, v. 83, n. 1, p. 157-170, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 18. | | DÉO, T. G.; CHIARI, L.; VILELA, M. de M.; SANTOS, M. F.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; JANK, L. Validação de um gene candidato ligado à apomixia em uma população segregante de Brachiaria decumbens. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro: resumos das palestras. p. 635| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 19. | | LARA, L. A. de C.; SANTOS, M. F.; JANK, L.; CHIARI, L.; VILELA, M. de M.; AMADEU, R. R.; SANTOS, J. P. R. dos; SILVA, F. G. da; ZENG, Z.-B.; GARCIA, A. A. F. Genomic Selection with Allele Dosage in Panicum maximum Jacq. G3: Genes|Genomes|Genetics, v. 9, p. 2463-2475, August 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 20. | | LARA, L. A. de C.; CAVALCANTE, D. N. C.; DÉO, T. G.; SANTOS, M. F.; CHIARI, L.; JANK, L.; VILELA, M. de M.; ZENG, Z. B.; GARCIA, A. A. F. Genotipagem por sequenciamento e dosagem alélica em Panicum maximum. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 12., 2016, Campo Grande, MS. p. 54-55.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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